依据《武器装备科研生产单位保密资格认定办法》，申请保密资格认证，需要经过的步骤主要包括：一是向国家或省级军工保密资格认证委提出申请；二是提交申请书和有关证明材料；三是接受国家或省级军工保密资格认证委组织的书面审查和现场审查；四是审查通过后取得保密资格证书。以下为工作具体开展的流程：

1、开具《保密资格认定等级建议表》（简称《密级建议表》）。有权开具密级建议表的单位包括：军队资格审查申请受理点、军工集团公司、项目总承包单位或者法律法规规定的有关部门。

2、企事单位依据《密级建议表》确定申请的密级，进行保密要害部门、部位的建设和保密档案的建立。

3、向国家或省（自治区、直辖市）保密行政管理部门（会同同级国防科技工业管理部门）报送申请书和有关材料，由省（自治区、直辖市）军工保密资格认证委组织进行保密资格认证的书面审查。书面审查通过后，准备迎接保密行政管理部门会同共同审批部门组织的现场审查。

4、国家或省（自治区、直辖市）军工保密资格认证委根据现场审查结论和有关材料，在规定日期内作出是否批准的决定，并将审查批准的保密资格申请单位有关材料报国家军工保密资格认证委备案。

5、国家军工保密资格认证委颁发《武器装备科研生产单位保密资格证书》。